1897年1月17日，谭嗣同完成重要哲学著作《仁学》，共2卷，5万多字。他杂糅儒、释、道、墨各家和西方资产阶级自然科学、社会政治经济学说，形成了独特的哲学体系。

他认为世界是物质的原质所构成，其本体是“仁”，“仁”是万物之源；“以太”构成万物的本质，是“不生不灭”的；宇宙间各种事物只有“变易”，没有“存亡”，只有“聚散”，没有“生灭”。

肯定了自然界和人类社会不是静止的、停顿的，而是不断运动、变化和发展的，批判了“天不变，道亦不变”的封建顽固思想，从变易中论证其改革社会制度的政治理想。

书中猛烈抨击“三纲五常”，指斥两千年来封建专制制度为“大盗”之政，专制君主是“独夫民贼”，宣传“君末民本”的民权思想，认为“君”如不能为“民”办事，亦可共废，否定了“君权神授”。

在《仁学》中，谭嗣同要求冲决封建主义的网罗，从而成为维新派中最激进的思想家。